Situado en Japón en el año 2071 en el que el mundo ha sido en su mayoría destruidas por misteriosos monstruos conocidos como los Aragami. Una organización conocida como Fenrir especializada en exterminar Aragami utilizando armas llamados God Arcs que se hace a partir de las células de un Aragami. Aquellos que se especializan en el exterminio de Aragamis se conocen como God Eaters. Originalmente los God Eaters pueden poseer una God Arcs de forma de armas o de forma hoja, sin embargo, un nuevo tipo se ha descubierto que puede transformar su arma entre una pistola y la forma de la hoja.